גינה בעיצוב טבעי, כשמה כן היא, נעדיף להשתמש בחומרים טבעיים. לכל הפחות, בחומרים עם מראה טבעי. דשא למשל, מגיע כיום גם בסוגים סינטטיים שנראים ריאליסטיים למדי, אפשר לנצל זאת, אך אם הולכים "עד הסוף" עם המראה הטבעי, נעדיף כמובן את אפשרות הדשא הטבעי. החומרים הנפוצים, הם מכמה סוגים שנפוצים בגינות: סלעים, אדמה, עצי נוי ופרי, פרחים, צמחי תבלין, צמחי מאכל, צמחים מטפסים, קקטוסים, סוקולנטים ודשא. כרגיל, יש בגינות אלמנטים נוספים, שלרוב אינם בהכרח "טבעיים". למשל כיסאות או פרגולות. אלמנטים כאלה יכולים להיות גם מחומר טבעי דוגמת עץ. עניין מיוחד הן הגדרות שמסביב לגינה או גדרות שמוקדמות לתיחום חלקים בתוך גינה גדולה. גדר כזו ניתן להקים בעזרת צמחיה ("גדר חיה") או לכל הפחות מעץ, לשם שמירת המראה הטבעי. בנושא הפתרונות לחיפוי הקרקע, יש אפשרויות טבעיות רבות. למשל חצץ, שבבי עץ, חלוקי נחל, טוף או חרס. שבילים ומשטחים אחרים לשימוש שוטף של אנשים, יכולים להיות גם הם מחומרים טבעיים. למשל דק מעץ או ריצוף מאבן טבעית. כך גם לגבי קישוטים שונים לגינה, דוגמת כדי חרס.

תאורת הגן היא נקודה חשובה מאוד ב תכנון גינה. יש לה תפקידים שימושיים כהארת שבילים ואזורי ישיבה וגם תפקידים אסתטיים, כהארת אזורים שרוצים להדגיש בגינה. מצד שני, תאורה מלאכותית היא לא דבר טבעי, במיוחד אם האור צבעוני. בגינה בעיצוב טבעי, ניתן לבחור בתאורה עם אור טבעי ככל האפשר. כמו כן, יש דרכים להצנעת גופי התאורה ולפיזור האור באופן יותר רחב (ולכן "טבעי") ופחות נקודתי.

רבים הבצלים והפקעות שאפשר לשתול בגינה הביתית. החצב הוא הגדול בבצלים של צמחי-הבר בארץ, המתאים לשתילה בגינה הפרטית ובפרט בגינה ארץ-ישראלית.

את החצב רצוי לשתול בקבוצות של חמש בצלים או יותר המעצימה את אפקט הפריחה.  שתילה בקבוצה מבטיח משך פריחה ארוך כשבצלים פורחים לסירוגים במהלך מספר שבועות בסוף הקיץ כאשר רוב צמחי הגינה כבר סיימו את פריחתם.

עמוד הפריחה של החצב המצוי המגיע למטר ויותר נותן גמישות רבה למיקום השתילה שלו בגינה, בחלק האחורי של ערוגה או בין צמחים בגובה בינוני.  פרחי החצב הלבנים בולטים לעין על רקע ירוק כהה, שיחים או עצים בעלי עלווה ירוקה צפופה כהה.

גינה ארץ ישראלית היא סגנון גינה בעלת מראה טבעי תוך שימוש בצמחייה ים תיכונית.

ציפורים וצמחים מקומיים נוצרו זה לזה תודות למיליוני שנים של אבולוציה. פירות צבעוניים מאכילים ציפורים והציפורים מחזירים טובה בהפצת זרעי הצמח התומכת במערכות אקולוגיות שלמות.

צמחים מקומיים הם מארחים חשובים עבור חרקים עשירים בחלבון כמו פרפרים וזחלים של עש, המהווים מרכיב מרכזי בהאכלת הגוזלים בקן. ציפורים מקומיים עיצבו את מעגל החיים שלהם סביב צמחים, הפירות שלהם והחרקים הנמשכים אליהם בעונות השונות.

קשרים אילו שזורים אחד בשני. שתילת מגוון צמחים יזמינו את הציפורים בהתאמה. שתילה של צמחייה מקומית המתאימה לאקלים בארץ זקוקה לפחות מי השקיה, פחות דשן ופחות אחזקה שוטפת כדי להראות במיטבה.